医用口罩的密封性要比纱布口罩好很多，医用口罩的最外层是光滑的防水层，可能阻隔空气中的水分子，将这种水分子阻隔在口罩之外，有些空气中非常小的细菌也可能会通过第一层进入到口罩中，口罩中间还有一层叫做熔喷布，它能阻隔0.3微米的颗粒物质，一般病菌下病毒的体积都会大于0.3微米，所以大部分的病菌都可以被阻隔在口罩之外。医用口罩的上端都有密封条能更加贴近面部，提高密封性。
棉纱口罩阻挡细菌的能力也比医用口罩的要差很多，因为大部分的细菌体积都非常小，在口罩中有湿气后，可能会通过空洞进入到口罩内，让人感染病菌。棉纱口罩没有密封条，与面部的贴合性也相对较差。医用口罩是在棉纱口罩的基础之上研发出来的，所以密封效果会更加好。